Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK1Q15118 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK1Q15118 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms