Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3GAP1Q15042 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB3GAP1Q15042 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
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