Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LARS2Q15031 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARS2Q15031 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LARS2Q15031 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms