Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1I3Q14994 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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