Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3AQ14563 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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