Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A6Q14031 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A6Q14031 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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