Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX3Q13761 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX3Q13761 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNX3Q13761 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNX3Q13761 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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