Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPBGQ13641 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPBGQ13641 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPBGQ13641 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPBGQ13641 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPBGQ13641 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPBGQ13641 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPBGQ13641 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPBGQ13641 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPBGQ13641 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPBGQ13641 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPBGQ13641 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPBGQ13641 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TPBGQ13641 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TPBGQ13641 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPBGQ13641 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPBGQ13641 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPBGQ13641 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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