Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SF3B2Q13435 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B2Q13435 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SF3B2Q13435 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SF3B2Q13435 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SF3B2Q13435 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
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