Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLF1Q13351 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF1Q13351 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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