Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA4Q13156 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA4Q13156 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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