Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECH1Q13011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms