Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK2Q13002 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK2Q13002 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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