Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPAL4Q0D2K0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPAL4Q0D2K0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPAL4Q0D2K0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms