Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFFO1Q0D2I5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFFO1Q0D2I5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms