Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CAMSAP2Q08AD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CAMSAP2Q08AD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CAMSAP2Q08AD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CAMSAP2Q08AD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CAMSAP2Q08AD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms