Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN3Q08043 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN3Q08043 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms