Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARHGAP1Q07960 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP1Q07960 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP1Q07960 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP1Q07960 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms