Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL18Q07020 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms