Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK18Q07002 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms