Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLE4Q04727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLE4Q04727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLE4Q04727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TLE4Q04727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TLE4Q04727 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLE4Q04727 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLE4Q04727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLE4Q04727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TLE4Q04727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms