Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC4Q03721 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms