Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAP1Q03518 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAP1Q03518 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAP1Q03518 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms