Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ROM1Q03395 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROM1Q03395 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROM1Q03395 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms