Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB1Q02641 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB1Q02641 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms