Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OC90Q02509 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OC90Q02509 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OC90Q02509 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OC90Q02509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OC90Q02509 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OC90Q02509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OC90Q02509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OC90Q02509 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OC90Q02509 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OC90Q02509 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OC90Q02509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OC90Q02509 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OC90Q02509 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OC90Q02509 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OC90Q02509 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OC90Q02509 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OC90Q02509 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OC90Q02509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OC90Q02509 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OC90Q02509 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OC90Q02509 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OC90Q02509 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OC90Q02509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OC90Q02509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OC90Q02509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OC90Q02509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OC90Q02509 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OC90Q02509 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OC90Q02509 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OC90Q02509 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OC90Q02509 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms