Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNC1Q01954 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNC1Q01954 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms