Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMP22Q01453 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMP22Q01453 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PMP22Q01453 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms