Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM2Q00987 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM2Q00987 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms