Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXC5Q00444 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC5Q00444 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms