Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MPP1Q00013 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MPP1Q00013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MPP1Q00013 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms