Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FOXO4P98177 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXO4P98177 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO4P98177 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO4P98177 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms