Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC1P63316 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms