Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKP1P63208 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKP1P63208 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKP1P63208 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKP1P63208 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKP1P63208 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKP1P63208 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKP1P63208 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKP1P63208 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKP1P63208 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKP1P63208 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKP1P63208 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKP1P63208 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKP1P63208 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKP1P63208 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKP1P63208 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKP1P63208 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKP1P63208 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKP1P63208 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKP1P63208 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKP1P63208 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKP1P63208 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKP1P63208 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKP1P63208 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKP1P63208 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKP1P63208 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKP1P63208 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKP1P63208 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKP1P63208 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKP1P63208 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKP1P63208 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKP1P63208 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKP1P63208 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKP1P63208 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKP1P63208 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKP1P63208 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKP1P63208 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms