Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V0D1P61421 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V0D1P61421 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V0D1P61421 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms