Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX1BP61266 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1BP61266 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1BP61266 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1BP61266 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1BP61266 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1BP61266 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1BP61266 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1BP61266 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1BP61266 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1BP61266 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1BP61266 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1BP61266 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1BP61266 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1BP61266 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1BP61266 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1BP61266 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1BP61266 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1BP61266 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1BP61266 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1BP61266 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1BP61266 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1BP61266 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1BP61266 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1BP61266 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1BP61266 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1BP61266 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1BP61266 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1BP61266 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1BP61266 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1BP61266 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1BP61266 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1BP61266 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms