Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMEM258P61165 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMEM258P61165 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMEM258P61165 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM258P61165 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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