Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BACE1P56817 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BACE1P56817 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BACE1P56817 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BACE1P56817 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BACE1P56817 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BACE1P56817 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BACE1P56817 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BACE1P56817 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BACE1P56817 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BACE1P56817 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BACE1P56817 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BACE1P56817 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BACE1P56817 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BACE1P56817 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BACE1P56817 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BACE1P56817 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BACE1P56817 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BACE1P56817 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BACE1P56817 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BACE1P56817 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BACE1P56817 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BACE1P56817 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BACE1P56817 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BACE1P56817 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BACE1P56817 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BACE1P56817 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BACE1P56817 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BACE1P56817 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BACE1P56817 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BACE1P56817 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BACE1P56817 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BACE1P56817 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BACE1P56817 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BACE1P56817 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BACE1P56817 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BACE1P56817 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BACE1P56817 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BACE1P56817 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BACE1P56817 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BACE1P56817 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BACE1P56817 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BACE1P56817 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BACE1P56817 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BACE1P56817 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BACE1P56817 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BACE1P56817 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BACE1P56817 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BACE1P56817 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BACE1P56817 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BACE1P56817 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BACE1P56817 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BACE1P56817 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BACE1P56817 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BACE1P56817 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BACE1P56817 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BACE1P56817 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BACE1P56817 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BACE1P56817 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BACE1P56817 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BACE1P56817 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BACE1P56817 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BACE1P56817 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BACE1P56817 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BACE1P56817 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BACE1P56817 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms