Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PER3P56645 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PER3P56645 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PER3P56645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PER3P56645 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PER3P56645 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PER3P56645 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PER3P56645 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PER3P56645 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PER3P56645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PER3P56645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PER3P56645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PER3P56645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PER3P56645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PER3P56645 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PER3P56645 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PER3P56645 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PER3P56645 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PER3P56645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PER3P56645 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PER3P56645 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PER3P56645 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PER3P56645 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PER3P56645 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PER3P56645 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PER3P56645 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PER3P56645 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PER3P56645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PER3P56645 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PER3P56645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PER3P56645 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PER3P56645 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms