Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A3P55017 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A3P55017 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A3P55017 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms