Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PMS2P54278 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P54278 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P54278 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P54278 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P54278 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P54278 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS2P54278 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
PMS2P54278 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P54278 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P54278 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P54278 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P54278 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P54278 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMS2P54278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMS2P54278 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMS2P54278 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms