Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLTCL1P53675 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLTCL1P53675 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLTCL1P53675 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLTCL1P53675 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms