Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK1P53667 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK1P53667 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIMK1P53667 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK1P53667 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms