Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MVDP53602 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVDP53602 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVDP53602 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVDP53602 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVDP53602 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVDP53602 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVDP53602 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVDP53602 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVDP53602 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MVDP53602 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVDP53602 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVDP53602 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVDP53602 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVDP53602 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVDP53602 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVDP53602 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MVDP53602 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MVDP53602 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVDP53602 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVDP53602 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MVDP53602 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVDP53602 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVDP53602 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVDP53602 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVDP53602 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVDP53602 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVDP53602 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVDP53602 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVDP53602 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVDP53602 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVDP53602 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVDP53602 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVDP53602 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVDP53602 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVDP53602 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVDP53602 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVDP53602 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVDP53602 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVDP53602 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms