Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A1P53007 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A1P53007 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A1P53007 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms