Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOP1P52888 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOP1P52888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THOP1P52888 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THOP1P52888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THOP1P52888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THOP1P52888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THOP1P52888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THOP1P52888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
THOP1P52888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THOP1P52888 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THOP1P52888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THOP1P52888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOP1P52888 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOP1P52888 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOP1P52888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOP1P52888 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THOP1P52888 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THOP1P52888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THOP1P52888 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THOP1P52888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THOP1P52888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOP1P52888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOP1P52888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOP1P52888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOP1P52888 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THOP1P52888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOP1P52888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOP1P52888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOP1P52888 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THOP1P52888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOP1P52888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOP1P52888 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THOP1P52888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THOP1P52888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THOP1P52888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms