Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA1P52294 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms