Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK2P51955 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK2P51955 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK2P51955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK2P51955 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK2P51955 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEK2P51955 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK2P51955 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK2P51955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK2P51955 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK2P51955 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK2P51955 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK2P51955 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK2P51955 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK2P51955 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK2P51955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK2P51955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK2P51955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEK2P51955 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK2P51955 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK2P51955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK2P51955 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK2P51955 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK2P51955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK2P51955 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK2P51955 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK2P51955 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK2P51955 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK2P51955 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK2P51955 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK2P51955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK2P51955 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms