Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DAP3P51398 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DAP3P51398 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DAP3P51398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DAP3P51398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DAP3P51398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DAP3P51398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DAP3P51398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DAP3P51398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DAP3P51398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DAP3P51398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DAP3P51398 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DAP3P51398 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DAP3P51398 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DAP3P51398 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DAP3P51398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DAP3P51398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DAP3P51398 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DAP3P51398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DAP3P51398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DAP3P51398 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DAP3P51398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms