Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL1P50553 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASCL1P50553 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms